Ο Γιώργος Μαργαρίτης γεννήθηκε στο Ρύμνιο Κοζάνης και κατοιεί στην Κοζάνη. Είναι παντρεμένος με την Ανατολή Σιδηρόπουλου και έχει δύο κόρες, τη Χρυσάνθη, καθηγήτρια αγγλικής φιλολογίας και τη Σοφία, καθηγήτρια ελληνικής φιλολογίας.
Εργάστηκε στη Διεύθυνση Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων της Περιφερειακής Ενότητας Κοζάνης απ’ όπου και συνταξιοδοτήθηκε.
Διετέλεσε Πρόεδρος της κοινότητας Ρυμνίου από το 1990 έως το 1998, Νομαρχιακός Σύμβουλος Κοζάνης τα έτη 2002 έως 2010, Αντινομάρχης Αγροτικής Ανάπτυξης Νομαρχίας Κοζάνης το 2009 και περιφερειακός σύμβουλος Δυτικής Μακεδονίας από το 2011 έως το 2021.
Από το 2022 είναι Αντιπεριφερειάρχης Δημόσιας Υγείας της Περιφέρειας Δυτικής Μακεδονίας.